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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

湖南嘉禾严厉打击“黑的”非法营运******url:https://m.gmw.cn/2023-01/06/content_1303246099.htm,id:1303246099

　　新华社客户端长沙1月6日电（邓和明、李红青）1月5日，湖南省嘉禾县交通运输局和交警大队联合出击，在城区排查违法开展营运行为的车辆，为即将到来的春节营造良好的交通运输环境。

　　近年来，嘉禾县把开展“黑的”非法营运整治作为交通问题顽瘴痼疾整治工作的一项重要内容。通过制定专项实施方案，进行调查摸底，发布整治通告，开展联合执法等措施，从公安交警、城管、交通运输、农业农村等部门中抽调业务精、素质高、作风硬的执法人员组成执法队伍，采取定点检查与流动检查，定期与不定期检查相结合的方法开展联合执法行动。

　　为严厉打击非法揽客，嘉禾县要求各私家车主不得在微信群、QQ群等网络平台发布招揽乘客等涉嫌“非法营运”的信息，不得利用各种方式为他人通风报信。如有发布者，经查实构成违法犯罪行为的，由公安部门依法查处，有非法营运行为的由交通运管部门依法从重处罚。同时，嘉禾县还设立了举报电话，发动广大市民积极举报非法营运车辆。

　　据统计，2022年以来，嘉禾县共查处非法营运车辆55辆，进一步净化道路旅客运输市场，力促客运市场规范有序发展。（完）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）